ESTRUCTURA Y DINÁMICA DEL ADN DURANTE LA REPLICACIÓN

Institución Proponente
Facultad Politécnica - FPUNA - UNA
Tipo de organización
Pública
Sitio web
Código
PINV15-573
Objetivo General del Proyecto
El principal interés del proyecto es comprender cómo se coordinan la estructura del ADN y la función de las topoisomersas durante la replicación. Para ello, utilizaremos la electroforesis bidimensional en geles de agarosa y la genética clásica en combinación con la simulación computacional para analizar el superenrollamiento, encadenamiento y anudamiento de moléculas de ADN durante la replicación y la dinámica de las moléculas parcialmente parcialmente replicadas en presencia o ausencia de las topoisomerasas.
Resultados Esperados
1. CONSTRUCCIÓN DE VECTORES Y PREPARACIÓN DE MUESTRAS DE ADN: a) Preparación de muestras ADN enriquecidas en moléculas de las siguientes familias: superenrollados (ScDimers), encadenados (CatAs) y anudados (KnDimers). b) Preparación de muestras ADN enriquecidas en moléculas de ADN parcialmente replicadas (Intermediarios de Replicación, RIs).
2. ÁNALISIS MEDIANTE ELECTROFORESIS BIDIMENSIONAL: Las muestras se someterán a electroforesis bidimensional, a diferentes concentraciones de agarosa y potencial electrostático, en presencia o ausencia de las topoisomersas. Mediante inmunodetecciones se analizarán los cambios en la movilidad electroforética de las moléculas como función de los parámetros anteriormente mencionados.
3. ANÁLISIS E INTERPRETACIÓN DE LOS DATOS: Las movilidades electroforéticas de las distintas familias serán analizadas mediante curvas de regresión; con estos resultados y los obtenidos por análisis de las inmunodetecciones se procederá a comparar las movilidades entre las diferentes familias y entre los topoisómeros de una misma familia.
4. SIMULACIÓN COMPUTACIONAL: a) En base a los datos recolectados de las inmunotecciones, se determinará la difusividad de cada topoisómero, este parámetro será utilizado en la simulación computacional de la ecuación de conservación y transporte de masa (Maxwell-Stefan). b) Se verificará el grado de concordancia entre los resultados experimentales y los de la simulación numérica.
5. PUBLICACIÓN FINAL Y DIVULGACIÓN: Considerando la originalidad del proyecto, pretendemos publicar los resultados en revistas internacionales. Además, se realizará un seminario gratuito sobre movilidad electroforética dirigido al público en general, especialmente a alumnos de carreras afines a la investigación.
Monto Financiado por Conacyt (G)
315.000.000
Monto Contrapartida (G)
188.350.896
Monto Total (G)
503.350.896
Monto Transferido (G)
309.462.100
Rendicion Presentada (Monto Conacyt) (G)
309.462.100
Estado del Proyecto
En ejecución
Modalidad
Proyectos de Investigación Institucional
Fecha de Inicio
Fecha de fin de Ejecucion
Fecha de Vigencia
NABs
7.3. PREVENCIÓN, VIGILANCIA Y CONTROL DE ENFERMEDADES TRANSMISIBLES Y NO TRANSMISIBLES
UNESCO
120318. SISTEMAS DE INFORMACION, DISEÑO Y COMPONENTES
OCDE
1.1. MATEMÁTICAS E INFORMÁTICA [MATEMÁTICAS Y OTRAS ÁREAS AFINES; INFORMÁTICA Y OTRAS DISCIPLINAS AFINES (SÓLO DESARROLLO DE SOFTWARE; EL DESARROLLO DE EQUIPOS DEBE CLASIFICARSE EN INGENIERÍA)]
ISIC
7120. ENSAYOS Y ANÁLISIS TÉCNICOS
Contratos / Adendas
# Descripción Firma Inicio Fin ejecución Fin vigencia
1 CONTRATO lB. Publica N° 067/2017 13/10/2017 16/10/2017 16/10/2019 14/01/2020
2 ADENDA N°01/2019 AL CONTRATO N°067/2017 - PINV15-573 11/09/2019 16/10/2017 16/02/2020 16/05/2020
3 ADENDA N°02/2020 AL CONTRATO N°067/2017 - PINV15-573 23/03/2020 16/10/2017 16/04/2020 15/07/2020
4 ADENDA N°03/2020 AL CONTRATO N°067/2017 - PINV15-573 16/06/2020 16/10/2017 30/06/2020 28/09/2020
Equipo
# Nombre Rol Resumen formación
1 María José Fernández Director del proyecto
2 Victor Manuel Martinez Chamorro Investigadores en formación
3 Dora B. Krimer Investigadores Asociados (nacionales o extranjeros)
4 María José Fernández Investigadores Principales (nacionales o extranjeros)
5 JORGE BERNARDO SCHVARTZMAN Investigadores Principales (nacionales o extranjeros)
6 Christian Emilio Schaerer Investigadores Asociados (nacionales o extranjeros)
7 Antonella María Marta Lobatti López Investigadores en formación